Neurobiologia teoretyczna 2010

Neurobiologia teoretyczna

Celem wykładów jest wprowadzenie do problematyki modelowania układu nerwowego od strony teoretycznej. Wykład będzie prowadzony na podstawie podręcznika Dayan i Abbotta "Theoretical Neuroscience". Informacje o tych spotkaniach i powiązanych wysyłane są na grupę dyskusyjną neuroinfo.

O ile nie zaznaczono inaczej spotkania odbywają się w piątki w Instytucie Biologii Doświadczalnej PAN, ul. Pasteura 3, w sali wykładowej na I piętrze o godz. 10.30.

Literatura pomocnicza:

• C. Koch „Biophysics of computation”
  
• D. Johnston, S. Wu „Foundations of cellular neurophysiology”
  
• P. Dayan, L. Abbott „Theoretical neuroscience. Computational and mathematical modeling of neural systems”
• Gary G. Matthews "Neurobiologia. Od cząsteczek i komórek do układów", Wydawnictwo Lekarskie PZWL
• Alan Longstaff "Neurobiologia. Krótkie wykłady", PWN
• Podręczniki do pakietów Neuron, Genesis, Matlab
• Strony internetowe podawane wg potrzeby

TEMATY SPOTKAŃ I MATERIAŁY DO CZYTANIA

1. 2010.02.26
   Dayan i Abbott, rozdział 5: Model Neurons 1: Neuroelectronics.
   Podrozdziały 5.1-5.4, strony 153 do 166.
   
   Omówiliśmy własności elektryczne błony komórkowej, modele jednoprzedziałowe i wspomnieliśmy modele integrate-and-fire.
   
   Zalecana literatura:
   
   • C. Koch „Biophysics of computation”
     • 1. The Membrane Equation
     • 14. Simplified Models of Individual Neurons
   • W. Gerstner i W. M. Kistler „Spiking Neuron Models"
     • 1. Introduction
     • 2.1 Equilibrium potential
     • 4.1 Integrate-and-fire model
2. 2010.03.05
   Maciek Cytowski:
   1) "Infrastruktura obliczeniowa ICM: Projekt POWIEW" M.Cytowski, M.Szpindler
   Franciszek Rakowski:
   2) "Symulacje typu ABM (Agent Based Model): metoda do wielorakich zastosowań"
   Darek Plewczyński zrobi wprowadzenie do:
   3) "Cognitive Computing: From Brain Modeling to Large Scale Machine Learning"
   
   na stronie grupy neuroinfo koledzy położyli kilka pożytecznych tekstów.
   
3. 2010.03.12
   Dayan i Abbott, rozdział 5: Model Neurons 1: Neuroelectronics.
   Podrozdziały 5.5-5.7, strony 166 do 178.
   
   Omówimy własności kanałów jonowych o przewodnościach zależnych od napięcia i równania Hodgkina-Huxleya.
   
   Zalecana literatura:

Daniel Wójcik