Pierwszy zjazd Polskiego Węzła INCF

Pierwsze Sympozjum Polskiego Węzła INCF
Warszawa, 16 grudnia 2011

Wprowadzenie

Wstępny Program - propozycja

• Informatyka w służbie neurobiologii
• 10:00 Daniel Wójcik, IBD PAN (IBD) "Wprowadzenie: neuroinformatyka, neurobiologia obliczeniowa i teoretyczna itd., INCF"
• 10:10 Piotr Majka, IBD "INCF Digital Atlasing Infrastructure i nasz udział: 3D Brain Atlas Reconstructor, http://www.3dbar.org/"
• 10:20 Jakub Kowalski, IBD "Trójwymiarowe modele struktur neuroanatomicznych na żądanie: http://service.3dbar.org/"
• 10:30 Piotr Durka, Wydział Fizyki UW (FUW): INCF Data Sharing Task Force, INCF Training in Neuroinformatics Task Force, Neuroinformatyka na FUW
• 10:40 Paweł Kordowski, FUW "SignalML 2.0 jako metaformat opisu danych, jak można z niego efektywnie korzystać?"
• Interfejsy mózg-komputer
• 10:50 Jarosław Żygierewicz, FUW "Jak odczytać intencje ruchowe - interfejsy mózg komputer"
• 11:00 Maciej Łabęcki, FUW "Optymalizacja bodźców SSVEP - interfejsy mózg - komputer"
• 11:10 Dawid Laszuk, FUW "Okulografia - wybrane zastosowania"
• 11:20-11:30 Przerwa
• Analiza danych EEG-fMRI
• 11:30 Tomasz Spustek, FUW "Zastosowanie algorytmu Matching Pursuit do analizy słabych sygnałów bioelektrycznych"
• 11:40 Ewa Gudowska-Nowak, Wydział Fizyki UJ (UJ) "Koherencja i synchronizacja w ukladach biologicznych"
• 11:50 Maciej A. Nowak, UJ "Projekt Cognilab w Centrum Badan Systemow Zlozonych im. Marka Kaca, UJ"
• 12:00 Jacek Tyburczyk, UJ "Korelacje w Regionach Brodmanna"
  Abstrakt:
  Wykorzystanie technik znanych z Teorii Macierzy Przypadkowych w analizie danych z fMRI ludzkiego mózgu wiąże się z wyliczaniem różnych charakterystyk dla macierzy korelacji. Ze względu na jej rozmiar, oraz niekorzystny stosunek długości serii czasowych do ilości źródeł sygnału konieczna jest redukcja danych wejściowych. W naszych badaniach wykorzystujemy w tym celu fizjologiczny podział na tzw. Regiony Brodmanna.
• 12:10 Bartosz Porębski, UJ "Narzędzia informatyczne do wizualizacji pracy mózgu"
  Abstrakt:
  Podczas badań nad zjawiskami zachodzącymi podczas pracy mózgu dużą rolę odgrywa wizualizacja danych w przestrzeni 3d. Tworzymy narzędzie pozwalające na wizualne śledzenie zmian przepływu krwi w mózgu (dane fMRI) w odniesieniu do fizjologicznych regionów Brodmanna. Wydajny kod w C++ pozwala na wykonywanie obliczeń w czasie rzeczywistym, biblioteka VTK (Visualization Toolkit) umożliwia przetwarzanie danych na obiekty trójwymiarowe, z kolei framework Qt odpowiada za interfejs użytkownika.
• 12:20 Łukasz Kuśmierz, UJ "Ograniczone maszyny Boltzmanna w analizie kolorowych obrazów"
  Abstrakt:
  Przedstawię koncepcję maszyny Boltzmanna oraz ograniczonej maszyny Boltzmanna (RBM). Następnie powiem, jak RBM można zastosować do uczenia (bez nauczyciela) rozpoznawania cech kolorowych obrazów. Pokażę nową metodę indukowania pożądanych rozkładów prawdopodobieństwa aktywacji neuronów oraz omówię dlaczego wskazane rozkłady prawdopodobieństwa są pożądane.
• Robotyka
  
• 12:30 Paweł Wawrzyński, PW "Robot humanoidalny sterowany przez uczącą się sieć neuronową"
• 12:40 Obiad
• Modelowanie i analiza potencjałów elektrycznych w mózgu
  
• 13:40 Szymon Łęski, IBD "Zasięg lokalnych potencjałów polowych"
  
• 13:50 Helena Głąbska, IBD "Modelowanie lokalnych potencjałów polowych w kolumnie korowej"
• 14:00 Jan Potworowski, IBD "Rekonstrukcja źródeł zewnątrzkomórkowych potencjałów elektrycznych metodą Kernel Current Source Density"
• 14:10 Jan Kacper Kamiński, IBD "Jak przewidzieć pojemność pamięci krótkotrwałej mierząc aktywność elektryczną mózgu (EEG)"
• 14:20 Aleksander Sobolewski, IBD "Analiza połączeń pomiędzy strukturami mózgu metodą Cross-Trial Correlation - zastosowanie w badaniu układu korowo-wzgórzowego szczura"
• 14:30 Maciej Kamiński, FUW "Model AR w analizie danych wielokanalowych"
• 14:40 Włodzimierz Klonowski, Michał Pierzchalski, Paweł Stępień, Robert Stępień, IBIB PAN "Nieliniowa analiza biosygnałów"
• 14:50-15:00 Przerwa
  
• Neurobiologia obliczeniowa
• 15:00 Włodzisław Duch, KIS UMK "Fenomika neuropsychiatryczna"
• 15:10 Grzegorz Wójcik, UMCS "Obliczenia płynowe w modelowaniu mózgu" oraz "Spektrum autyzmu - zintegrowana teoria"
• 15:20 Joanna Jędrzejewska-Szmek, FUW "Krótkoczasowe modele plastyczności synaptycznej"
• 15:30 Jacek Rogala, IBD "Hamowanie zwrotne i wolny upływ wapnia w interneuronach PGN wyjaśniają zmiany spontanicznej aktywności komórek wzgórzowych po deaktywacji kory"
• 15:40 Piotr Suffczyński, FUW "Modelowanie czynnosci epileptycznej"
• 15:50 Janusz Szczepański, IPPT PAN, Bartosz Paprocki UKW,"Efektywność transmisji informacji w sieciach neuronowych w ujęciu teorii Shannona"
• 16:00 Franciszek Rakowski, ICM UW, "Computational modeling of the interneuronal circuit of Caenorhabditis Elegans"
• 16:10 Piotr Durka, FUW "Neuroinformatyka w Polsce - skąd się to wzięło?"
• 16:20 Przerwa
• 16:40-18:00 Polski węzeł INCF - finansowanie, funkcjonowanie, wizja

• Marek Jakowczyk, IFT, Uniw. Wrocławski
  
• Katarzyna Blinowska, FUW
• Sławomir Kotyra, UMCS
• Piotr Wierzgała, UMCS
• Krzysztof Dmitruk, UMCS
  
• Marcin Wazny, UMCS
  
• Tiaza Bem, IBIB PAN
  
• Tomasz Piotrowski, KIS UMK
  
• Andrzej Wróbel, IBD PAN