Other

Przewodnik dla naszej grupy

Matematyka

• Procesy stochastyczne punktowe
• teoria informacji
• analiza Fouriera
• metody analizy sygnałów
• klasyfikacja
• falki
• synchronizacja
  

Komputerowe

• Matlab: jest u nas standardem w analizie danych. W dalszej perspektywie myślę o przejściu na R, ale póki co korzystamy z Matlaba. Na początek polecam przejście przez "Getting started". Przydatne są tutoriale do Matlaba, których można znaleźć mnóstwo w Google'u. W szczególności polecam "MATLAB Primer" (Third Edition for MATLAB v4; 35 pages) napisany przez Kermita Sigmona. Nie wiem gdzie jest oryginalne strona. Stary primer można znaleźć np. tu lub przez Google. Inną książką dostępną online jest "Numerical Computing with MATLAB" C. Mollera.
  
• Genesis: jeden z dwóch najpopularniejszych programów do symulacji układu nerwowego. Drugi to Neuron dostępny w Yale i w Duke University. Zdecydowałem się na GENESIS, ponieważ wydaje mi się, że lepiej nadaje się do modelowania dużych sieci neuronalnych, co jest jednym z naszych celów. Oczywiście, przetestujemy również Neurona. Autorzy GENESIS udostępnili podręcznik do programu na swojej stronie. Zarówno GENESIS jak i Neuron są darmowe. Polecam artykuły z konferencji poświęconej modelowaniu z 2005 roku. Na stronie GENESIS jest dużo użytecznych informacji dla użytkowników. Jeszcze więcej można skorzystać po zapisaniu się do grupy użytkowników GENESIS zwanej BABEL (info na stronie).
  
• C: użyteczny sam w sobie kiedy coś musi działać szybko. GENESIS jest napisane w C, żeby móc pisać nowe moduły musimy go znać. Podstawowy podręcznik to oczywiście B. Kernighan i D. Ritchie "Język C" WNT. Prostszy podręcznik dla początkujących: S. Oualline "Practical C Programming", O'Reilly. Dostepne jest polskie tłumaczenie. Podstawowy przewodnik po języku rozstrzygajacy wątpliwości składniowe itp: Harbison, Steele "C: a reference manual".
  
• Java: staje się standardem przemysłowym, coraz częściej wykorzystywana w nauce. Nas interesuje m.in. dlatego, że nowy interfejs do GENESIS przygotowywany jest w Javie. Jest mnóstwo książek do Javy, trudno coś polecić. Mamy tu Horstmann, Cornell "Core Java". Niektórzy chwalą sobie B. Eckela "Thinking in Java". Najlepiej zacząć od tutoriali na stronach Suna. Pojawiło się też kilka książek do zastosowań naukowych Javy. których nie mamy w pracowni: Lindsey CS et al "JavaTech: An introduction to scientific and technical computing with Java", G. Palmer "Technical Java. Developing Scientific and engineering applications".
  

Fizyka

• Elektrodynamika ośrodków materialnych:
• P. L. Nunez "Electric fields of the brain"

Neurobiologia

• ogólny kurs:
  
• z pozycji dostępnych po polsku ogólnie polecany jest podręcznik  G. G. Matthewsa "Neurobiologia. Od cząsteczek i komórek do układów", Wyd. Lekarskie PZWL (1998). Alternatywa: A. Longstaff "Krótkie wykłady: Neurobiologia", Wyd. Naukowe PWN (2002). Ta książka ma inny charakter, służy raczej do systematyzacji wiedzy przed egzaminem, w związku z czym mniej się nadaje na pierwszy podręcznik. "Mózg a zachowanie" Wyd. Naukowe PWN też jest użyteczny, ale ma jeszcze inny charakter.
  
• po angielsku jest znacznie większy wybór literatury. Standardem u nas jest Kandel et al. "Principles of neural science". Inne książki godne polecenia to Bear et al. "Neuroscience" albo Martin et al.  "From neuron to brain".
• neurobiologia teoretyczna:
• P. Dayan i L. Abbott "Theoretical neuroscience" - od tego proponuję zacząć.
  
• Rieke  et al. "Spikes. Exploring the neural code"
• C. Koch i I. Segev "Methods in neuronal modeling"
• C. Koch "Biophysics o computation"
• W. Gerstner i W. Kistler "Spiking neural models"
• D. Johnston i S. Wu "Foundations of cellular neurophysiology"
• H. C. Tuckwell "Introduction to theoretical neurobiology"
• M. Abeles "Corticonics. Neural circuits of the cerebral cortex"
• T. Sejnowski i P. Churchland "Coputational brain"